幾年前，Windows專用伺服器託管和Linux之間存在根本的區別。但是，如今使用不同主機的公司可以享受兼容服務，從而在某種程度上減少差異。如果您投資了錯誤的伺服器或主機程序包，那麼多多嘗試都不會令您滿意。因此，只有在了解伺服器的異同之後，才選擇伺服器或主機程序包。在選擇伺服器或主機程序包之前，還必須確保確定操作系統。
可訪問性：在Windows專用伺服器託管和Linux中將看到的主要區別之一是訪問每個伺服器的方式。儘管這兩個伺服器都允許您通過FTP進行訪問並遵循用於傳輸信息的方式，但是您只能通過Linux Hosting遠程訪問伺服器。您可以在兩個伺服器中交換文件，但是只有Windows專用伺服器託管允許您通過提供高級控制選項來訪問伺服器的更多重要部分。
開發：在設計和開發Linux Hosting系統標準時要牢記技術人員和程序員的要求。這些應用程序稍後會被利用，因此，作為最終客戶，您可以基於Linux Hosting系統獲得最佳功能。此外，您還可以享受Linux Hosting系統中發生的開發，以便獲得改進的服務。與Linux主機系統相反，Windows專用伺服器主機是直接為最終客戶開發的。因此，它不那麼複雜。
編程語言：Linux Hosting和Windows Dedicated Server Hosting之間的另一個值得注意的區別是兩個伺服器都使用了編程語言。在服務提供商藉助CGI，PHP或Perl編程語言創建Linux託管系統的同時，Windows專用伺服器託管是在ColdFusion，ASP和.NET的幫助下創建的。您甚至可以在資料庫管理系統中找到差異，因為Linux使用MySQL資料庫管理，而Windows Hosting使用SQL Server或MS Access。因此，您可以了解直接影響網站甚至連接到這兩個平台的應用程序的開發過程的因素。
功能：有時您會看到一些開發人員試圖使網站或應用程序與Windows Server友好，以便它們可以在Windows系統上平穩運行。但是，Linux Hosting系統上的應用程序或網站也可以在Windows計算機上運行。在這種情況下，您不會遇到與伺服器編程語言有關的任何問題，並且可以輕鬆訪問數據。在利用任何伺服器的功能時可以享受的另一個好處是，您獲得了根主席的支持。因此，您可以運行任何任務而不會遇到任何問題。 Linux主機系統在專用伺服器方面表現不錯，並且隨著基於該系統的軟體和應用程序的可用性，它變得越來越強大。
用法：Windows專用伺服器託管如此受歡迎的主要原因之一是易於使用的界面。由於Windows專用伺服器託管的用戶界面易於訪問，因此您可以輕鬆訪問和監視連接的計算機。您只需註冊您的伺服器帳戶即可訪問附近的已連接計算機。但是，您可能需要一些時間來熟悉該過程，因為該流程只能以某些有時會令人煩惱的命令運行。另一方面，由於不同的人在創建Windows專用伺服器託管系統時表達了自己的想法，因此使用變得非常容易。您無需擔心在使用伺服器時會遇到任何問題，因為系統的用戶界面簡單而有效。
安全性：就安全性而言，眾所周知Linux託管系統比Windows專用伺服器託管更安全。您無需付費即可訪問Linux的操作系統。因此，您可以進行更改以改善伺服器的服務。任何人都可以公開訪問源代碼。在使源保持開放的過程中，黑客試圖闖入伺服器並破壞系統，但失敗了。這僅是因為大型社區一直在支持Linux Hosting服務的創建和改進。儘管是開源的。
反之， Windows專用伺服器託管 通過開發一些Service Pack或Windows Update或修補程序來修補差距。有一支專門的開發人員團隊，他們試圖確保主機伺服器的安全。即使伺服器是開源的，Windows系統也更容易受到病毒攻擊。一般而言，大部分應用程序是根據用戶需求定製的，而不是特定於您的個人需求的。在任何一台伺服器中，合格的專業人員都會照顧伺服器的安全並維護其安全性，以便您可以輕鬆使用伺服器。
費用：必須牢記的最後也是最重要的一點，可以決定的因素是兩台伺服器的費用。您必須是Windows專用伺服器託管的授權用戶，因為這是Microsoft產品，並且其安全措施非常嚴格。因此，您必須支付巨額費用才能使用伺服器，並且可能不會重複收費。另一方面，您可以免費使用Linux Hosting系統，因為這是一個開源程序。因此，對您徵收的費用基本上是零。顯然，與Windows專用伺服器託管系統相比，Linux託管系統具有成本效益。